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假基因活动与进化

日期:2014-08-27 00:00:00

一项研究发现,生物的假基因补充物可能提供塑造了生物基因组的机制的见解。每一种生物的基因组都含有假基因,它们多数是没有功能版本的基因,但是一些假基因被认为有助于调控基因表达。假基因还可能提供基因组进化的见解,因为它们在比为蛋白质编码的基因的选择约束更低的条件下突变。

为了研究假基因的潜在功能与基因组进化,Mark B. Gerstein及其同事分析了基因组数据并且组织了人类、线虫(Caenorhabidis elegans)和果蝇(Drosophila melanogaster)基因组的假基因注释,这些基因组是由DNA元素百科全书(ENCODE)与模式生物ENCODE项目提供的。

研究人员发现,在人类基因组内的这些假基因补充物以加工假基因为主,这是插入到基因组中的信使RNA的拷贝,而假基因的暴发起源于大约在灵长类最初进化出来的时候。相比之下,线虫和果蝇的假基因补充物主要含有复制的假基因。研究人员表示,单个的分类学门可能含有特征性的假基因补充物,能揭示出某些形成基因组的进化过程。

此外,研究人员观察到了这3个门中的大约75%的假基因表现出了某种程度的生物化学活动, 并且具有类似基因的特征,这提示某些假基因可能拥有尚未发现的生物功能;研究人员表示,特别是这3个门每个都有大约15%的假基因是转录的,这揭示出了这些门的假基因活动的一种可能的相似性。

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