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让基因表达分析更快更便宜的方法

日期:2015-03-06 00:00:00

最近,耶鲁大学的一个研究团队,开发了一种简单的方法,能明显降低大规模基因表达分析的时间和成本。相关研究结果三月二日发表在Nature旗下子刊《自然方法》(Nature Methods)。该研究团队由耶鲁医学院放射治疗学助理教授、医学博士Abhijit Patel带领,他们创建了一种工具,利用新一代高通量DNA测序技术,使大家能够更容易的同时测量大量细胞或组织中的基因活性。而DNA被认为是生命的蓝图,知道在不同条件下哪些基因被激活或关闭,是大家理解生物学和疾病的基础。

 
这种方法称为模块化早期标记扩增(meta)RNA谱,可以在许多样本中同时量化各种microRNA或mRNA,而且比现有的数字分析技术需要更少的测序深度。这种方法可在反转录过程中分配定量标签,以在竞争性扩增和深度测序之前使前期样本混合。这种简单的、可扩展的、便宜的方法,提高了大规模基因表达研究的实用性。
 
基因表达分析是临床试验中常用的。例如,在乳腺癌患者中,往往通过检测肿瘤标本中的基因表达来预测复发的可能性,以确定化疗是否是有益的。Patel说,另外有研究验证,这种高通量的方法可用来同时测量许多患者肿瘤的基因表达。最后,该方法能够减少这种检测的成本,使他们更加的广泛可用。
 
本文资深编辑Patel说:“为了得出关于复杂基因表达模式的有意义的结论,通常需要对大量的临床或实验样品进行统计分析。大家相信,这项新技术将有助于此类工作的开展。大家很兴奋,因为这种方法使得大规模RNA谱研究更加实用,并且更容易为大多数研究人员和临床实验室所用。”

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